自學考試的畢業證書由省考委頒發，主考院校副署。為體現國家考試的嚴肅性、權威性，自2003年起，自學考試的畢業證書由全國考委統一制作。
自考畢業證書自２００１年６月起全國已實行電子注冊、備案制度。目前，中國高等教育學生信息網（http://www.chis.com..cn）、高等教育自學考試信息網（http://www.ste.net.cn）湖北教育考試院網（www.hbea.edu.cn）向社會提供證書查詢認證服務。
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